Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SREBF1P36956 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SREBF1P36956 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms