Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHKAP35790 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHKAP35790 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHKAP35790 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHKAP35790 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHKAP35790 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHKAP35790 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHKAP35790 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHKAP35790 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHKAP35790 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHKAP35790 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHKAP35790 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHKAP35790 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHKAP35790 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHKAP35790 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHKAP35790 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHKAP35790 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHKAP35790 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHKAP35790 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHKAP35790 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CHKAP35790 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHKAP35790 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHKAP35790 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHKAP35790 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHKAP35790 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHKAP35790 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHKAP35790 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHKAP35790 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHKAP35790 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHKAP35790 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHKAP35790 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHKAP35790 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHKAP35790 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHKAP35790 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHKAP35790 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHKAP35790 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKAP35790 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKAP35790 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKAP35790 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKAP35790 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKAP35790 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKAP35790 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKAP35790 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKAP35790 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKAP35790 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKAP35790 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKAP35790 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKAP35790 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKAP35790 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKAP35790 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKAP35790 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKAP35790 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKAP35790 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKAP35790 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKAP35790 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKAP35790 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKAP35790 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKAP35790 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKAP35790 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKAP35790 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKAP35790 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKAP35790 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHKAP35790 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHKAP35790 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHKAP35790 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHKAP35790 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHKAP35790 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHKAP35790 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHKAP35790 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHKAP35790 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHKAP35790 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHKAP35790 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHKAP35790 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHKAP35790 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHKAP35790 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHKAP35790 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHKAP35790 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHKAP35790 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHKAP35790 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHKAP35790 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHKAP35790 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHKAP35790 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHKAP35790 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHKAP35790 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHKAP35790 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHKAP35790 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHKAP35790 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHKAP35790 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHKAP35790 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHKAP35790 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHKAP35790 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHKAP35790 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHKAP35790 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHKAP35790 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHKAP35790 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHKAP35790 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHKAP35790 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHKAP35790 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHKAP35790 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHKAP35790 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms