Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKARP32238 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKARP32238 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKARP32238 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKARP32238 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKARP32238 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKARP32238 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKARP32238 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKARP32238 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKARP32238 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKARP32238 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKARP32238 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKARP32238 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCKARP32238 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKARP32238 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKARP32238 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKARP32238 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKARP32238 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKARP32238 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKARP32238 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKARP32238 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKARP32238 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKARP32238 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKARP32238 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKARP32238 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKARP32238 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKARP32238 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKARP32238 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKARP32238 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCKARP32238 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKARP32238 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKARP32238 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKARP32238 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKARP32238 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKARP32238 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKARP32238 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKARP32238 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKARP32238 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKARP32238 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKARP32238 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKARP32238 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKARP32238 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKARP32238 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKARP32238 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKARP32238 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKARP32238 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKARP32238 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKARP32238 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKARP32238 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKARP32238 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKARP32238 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKARP32238 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKARP32238 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKARP32238 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKARP32238 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKARP32238 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKARP32238 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKARP32238 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKARP32238 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKARP32238 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKARP32238 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKARP32238 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKARP32238 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKARP32238 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKARP32238 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKARP32238 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKARP32238 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKARP32238 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCKARP32238 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCKARP32238 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCKARP32238 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCKARP32238 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCKARP32238 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKARP32238 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKARP32238 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKARP32238 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKARP32238 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKARP32238 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKARP32238 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKARP32238 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKARP32238 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKARP32238 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKARP32238 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKARP32238 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKARP32238 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKARP32238 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKARP32238 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKARP32238 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKARP32238 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKARP32238 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKARP32238 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKARP32238 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKARP32238 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKARP32238 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKARP32238 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKARP32238 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKARP32238 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKARP32238 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKARP32238 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKARP32238 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms