Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CLIP1P30622 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
CLIP1P30622 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
CLIP1P30622 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
CLIP1P30622 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms