Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCND3P30281 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCND3P30281 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCND3P30281 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCND3P30281 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND3P30281 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND3P30281 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND3P30281 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND3P30281 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND3P30281 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND3P30281 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND3P30281 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND3P30281 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND3P30281 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND3P30281 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND3P30281 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND3P30281 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCND3P30281 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCND3P30281 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCND3P30281 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCND3P30281 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCND3P30281 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCND3P30281 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCND3P30281 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCND3P30281 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCND3P30281 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCND3P30281 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCND3P30281 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCND3P30281 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCND3P30281 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCND3P30281 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCND3P30281 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCND3P30281 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCND3P30281 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCND3P30281 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCND3P30281 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCND3P30281 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCND3P30281 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND3P30281 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND3P30281 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND3P30281 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND3P30281 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND3P30281 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND3P30281 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND3P30281 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND3P30281 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND3P30281 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND3P30281 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND3P30281 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND3P30281 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND3P30281 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND3P30281 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND3P30281 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND3P30281 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND3P30281 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND3P30281 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCND3P30281 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCND3P30281 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCND3P30281 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCND3P30281 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCND3P30281 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCND3P30281 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCND3P30281 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCND3P30281 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCND3P30281 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND3P30281 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND3P30281 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND3P30281 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND3P30281 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND3P30281 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND3P30281 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND3P30281 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND3P30281 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND3P30281 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND3P30281 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND3P30281 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND3P30281 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND3P30281 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND3P30281 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND3P30281 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND3P30281 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND3P30281 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND3P30281 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND3P30281 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND3P30281 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND3P30281 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND3P30281 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCND3P30281 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCND3P30281 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCND3P30281 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND3P30281 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND3P30281 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND3P30281 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND3P30281 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND3P30281 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND3P30281 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND3P30281 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND3P30281 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND3P30281 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND3P30281 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms