Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCND2P30279 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCND2P30279 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND2P30279 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND2P30279 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND2P30279 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND2P30279 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND2P30279 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND2P30279 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND2P30279 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND2P30279 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCND2P30279 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCND2P30279 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND2P30279 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND2P30279 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND2P30279 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND2P30279 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND2P30279 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND2P30279 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND2P30279 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCND2P30279 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCND2P30279 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCND2P30279 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCND2P30279 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCND2P30279 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCND2P30279 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCND2P30279 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCND2P30279 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCND2P30279 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCND2P30279 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND2P30279 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND2P30279 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND2P30279 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND2P30279 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND2P30279 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND2P30279 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND2P30279 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND2P30279 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND2P30279 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND2P30279 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND2P30279 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND2P30279 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND2P30279 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND2P30279 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND2P30279 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND2P30279 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND2P30279 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND2P30279 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND2P30279 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND2P30279 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND2P30279 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND2P30279 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND2P30279 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND2P30279 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND2P30279 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND2P30279 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND2P30279 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND2P30279 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND2P30279 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND2P30279 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND2P30279 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND2P30279 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND2P30279 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND2P30279 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND2P30279 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND2P30279 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND2P30279 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND2P30279 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND2P30279 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND2P30279 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCND2P30279 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCND2P30279 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCND2P30279 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCND2P30279 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCND2P30279 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCND2P30279 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCND2P30279 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCND2P30279 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND2P30279 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND2P30279 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND2P30279 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND2P30279 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND2P30279 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND2P30279 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND2P30279 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND2P30279 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND2P30279 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND2P30279 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCND2P30279 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCND2P30279 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCND2P30279 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCND2P30279 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCND2P30279 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCND2P30279 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCND2P30279 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCND2P30279 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCND2P30279 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCND2P30279 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCND2P30279 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCND2P30279 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms