Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM5AP29375 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
KDM5AP29375 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
KDM5AP29375 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms