Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1CP29017 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1CP29017 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1CP29017 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1CP29017 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD1CP29017 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD1CP29017 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD1CP29017 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD1CP29017 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CD1CP29017 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD1CP29017 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CD1CP29017 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD1CP29017 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD1CP29017 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD1CP29017 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD1CP29017 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD1CP29017 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD1CP29017 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CD1CP29017 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CD1CP29017 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD1CP29017 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD1CP29017 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD1CP29017 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD1CP29017 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD1CP29017 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD1CP29017 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CD1CP29017 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD1CP29017 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD1CP29017 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD1CP29017 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD1CP29017 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD1CP29017 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD1CP29017 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD1CP29017 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD1CP29017 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD1CP29017 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD1CP29017 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD1CP29017 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD1CP29017 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD1CP29017 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CD1CP29017 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD1CP29017 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CD1CP29017 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD1CP29017 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD1CP29017 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD1CP29017 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD1CP29017 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD1CP29017 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CD1CP29017 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD1CP29017 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD1CP29017 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD1CP29017 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD1CP29017 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD1CP29017 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD1CP29017 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD1CP29017 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD1CP29017 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD1CP29017 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD1CP29017 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD1CP29017 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD1CP29017 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD1CP29017 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CD1CP29017 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD1CP29017 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD1CP29017 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD1CP29017 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD1CP29017 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD1CP29017 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD1CP29017 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD1CP29017 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD1CP29017 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD1CP29017 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD1CP29017 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD1CP29017 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD1CP29017 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD1CP29017 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD1CP29017 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD1CP29017 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD1CP29017 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD1CP29017 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD1CP29017 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD1CP29017 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD1CP29017 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD1CP29017 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD1CP29017 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD1CP29017 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD1CP29017 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD1CP29017 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD1CP29017 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD1CP29017 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CD1CP29017 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD1CP29017 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD1CP29017 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD1CP29017 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD1CP29017 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CD1CP29017 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CD1CP29017 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD1CP29017 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD1CP29017 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD1CP29017 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms