Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMBRP28336 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMBRP28336 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMBRP28336 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMBRP28336 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NMBRP28336 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMBRP28336 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMBRP28336 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMBRP28336 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMBRP28336 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMBRP28336 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMBRP28336 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NMBRP28336 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMBRP28336 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMBRP28336 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMBRP28336 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMBRP28336 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMBRP28336 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMBRP28336 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMBRP28336 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMBRP28336 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMBRP28336 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMBRP28336 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMBRP28336 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMBRP28336 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMBRP28336 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMBRP28336 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMBRP28336 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMBRP28336 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMBRP28336 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMBRP28336 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMBRP28336 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NMBRP28336 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NMBRP28336 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NMBRP28336 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMBRP28336 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMBRP28336 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMBRP28336 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMBRP28336 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMBRP28336 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMBRP28336 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMBRP28336 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMBRP28336 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMBRP28336 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMBRP28336 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMBRP28336 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMBRP28336 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMBRP28336 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMBRP28336 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMBRP28336 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMBRP28336 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMBRP28336 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NMBRP28336 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMBRP28336 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NMBRP28336 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMBRP28336 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMBRP28336 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMBRP28336 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMBRP28336 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMBRP28336 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMBRP28336 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMBRP28336 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMBRP28336 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMBRP28336 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NMBRP28336 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMBRP28336 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMBRP28336 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMBRP28336 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMBRP28336 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMBRP28336 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMBRP28336 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMBRP28336 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMBRP28336 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMBRP28336 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMBRP28336 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NMBRP28336 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMBRP28336 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMBRP28336 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMBRP28336 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMBRP28336 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMBRP28336 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMBRP28336 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMBRP28336 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMBRP28336 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NMBRP28336 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMBRP28336 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMBRP28336 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMBRP28336 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMBRP28336 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMBRP28336 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NMBRP28336 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMBRP28336 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NMBRP28336 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMBRP28336 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMBRP28336 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMBRP28336 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMBRP28336 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMBRP28336 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMBRP28336 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMBRP28336 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
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