Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CTNNA2P26232 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNNA2P26232 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms