Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPREP23469 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPREP23469 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPREP23469 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPREP23469 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPREP23469 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPREP23469 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPREP23469 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPREP23469 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPREP23469 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPREP23469 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPREP23469 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPREP23469 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPREP23469 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPREP23469 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPREP23469 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPREP23469 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPREP23469 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPREP23469 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPREP23469 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPREP23469 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPREP23469 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPREP23469 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPREP23469 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPREP23469 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPREP23469 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPREP23469 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPREP23469 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPREP23469 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPREP23469 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPREP23469 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPREP23469 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPREP23469 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPREP23469 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPREP23469 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPREP23469 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPREP23469 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPREP23469 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPREP23469 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPREP23469 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPREP23469 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPREP23469 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPREP23469 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPREP23469 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPREP23469 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPREP23469 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPREP23469 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPREP23469 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPREP23469 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPREP23469 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPREP23469 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPREP23469 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPREP23469 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPREP23469 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPREP23469 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPREP23469 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPREP23469 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPREP23469 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPREP23469 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPREP23469 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPREP23469 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPREP23469 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPREP23469 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPREP23469 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPREP23469 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPREP23469 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPREP23469 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPREP23469 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPREP23469 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPREP23469 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPREP23469 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPREP23469 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPREP23469 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPREP23469 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPREP23469 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPREP23469 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPREP23469 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPREP23469 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPREP23469 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPREP23469 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPREP23469 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPREP23469 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPREP23469 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPREP23469 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPREP23469 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPREP23469 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPREP23469 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPREP23469 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPREP23469 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPREP23469 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPREP23469 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPREP23469 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPREP23469 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPREP23469 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPREP23469 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPREP23469 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPREP23469 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPREP23469 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPREP23469 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPREP23469 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms