Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLDCP23378 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLDCP23378 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLDCP23378 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GLDCP23378 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLDCP23378 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLDCP23378 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLDCP23378 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLDCP23378 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLDCP23378 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLDCP23378 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLDCP23378 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLDCP23378 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLDCP23378 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLDCP23378 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLDCP23378 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLDCP23378 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLDCP23378 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLDCP23378 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLDCP23378 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GLDCP23378 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLDCP23378 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GLDCP23378 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLDCP23378 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLDCP23378 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLDCP23378 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GLDCP23378 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLDCP23378 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLDCP23378 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLDCP23378 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLDCP23378 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLDCP23378 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GLDCP23378 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLDCP23378 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLDCP23378 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLDCP23378 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLDCP23378 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GLDCP23378 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GLDCP23378 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GLDCP23378 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GLDCP23378 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLDCP23378 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLDCP23378 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLDCP23378 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GLDCP23378 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLDCP23378 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLDCP23378 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLDCP23378 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLDCP23378 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLDCP23378 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLDCP23378 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GLDCP23378 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GLDCP23378 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLDCP23378 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GLDCP23378 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLDCP23378 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLDCP23378 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLDCP23378 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLDCP23378 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLDCP23378 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLDCP23378 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GLDCP23378 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLDCP23378 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLDCP23378 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLDCP23378 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GLDCP23378 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLDCP23378 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLDCP23378 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GLDCP23378 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLDCP23378 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLDCP23378 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLDCP23378 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLDCP23378 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLDCP23378 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLDCP23378 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLDCP23378 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLDCP23378 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLDCP23378 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLDCP23378 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLDCP23378 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLDCP23378 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLDCP23378 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLDCP23378 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLDCP23378 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLDCP23378 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLDCP23378 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLDCP23378 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLDCP23378 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLDCP23378 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLDCP23378 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GLDCP23378 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GLDCP23378 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLDCP23378 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLDCP23378 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLDCP23378 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLDCP23378 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GLDCP23378 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLDCP23378 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLDCP23378 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLDCP23378 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms