Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACO1P21399 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ACO1P21399 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACO1P21399 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACO1P21399 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACO1P21399 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACO1P21399 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACO1P21399 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACO1P21399 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACO1P21399 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACO1P21399 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACO1P21399 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACO1P21399 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACO1P21399 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACO1P21399 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACO1P21399 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACO1P21399 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACO1P21399 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACO1P21399 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACO1P21399 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACO1P21399 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACO1P21399 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ACO1P21399 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACO1P21399 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACO1P21399 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACO1P21399 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACO1P21399 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACO1P21399 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACO1P21399 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACO1P21399 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACO1P21399 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACO1P21399 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACO1P21399 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACO1P21399 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACO1P21399 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACO1P21399 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACO1P21399 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACO1P21399 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACO1P21399 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACO1P21399 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ACO1P21399 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACO1P21399 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACO1P21399 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACO1P21399 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACO1P21399 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACO1P21399 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACO1P21399 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACO1P21399 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACO1P21399 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACO1P21399 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACO1P21399 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACO1P21399 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACO1P21399 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACO1P21399 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACO1P21399 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACO1P21399 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACO1P21399 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACO1P21399 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACO1P21399 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACO1P21399 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACO1P21399 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACO1P21399 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACO1P21399 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACO1P21399 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACO1P21399 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ACO1P21399 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACO1P21399 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACO1P21399 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACO1P21399 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACO1P21399 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACO1P21399 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACO1P21399 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACO1P21399 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACO1P21399 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACO1P21399 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACO1P21399 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACO1P21399 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACO1P21399 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACO1P21399 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACO1P21399 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACO1P21399 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACO1P21399 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACO1P21399 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACO1P21399 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACO1P21399 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ACO1P21399 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACO1P21399 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACO1P21399 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACO1P21399 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACO1P21399 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACO1P21399 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACO1P21399 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ACO1P21399 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACO1P21399 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACO1P21399 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACO1P21399 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACO1P21399 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACO1P21399 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACO1P21399 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACO1P21399 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms