Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGB5P18084 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB5P18084 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms