Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXB4P17483 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB4P17483 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
HOXB4P17483 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB4P17483 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB4P17483 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB4P17483 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB4P17483 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB4P17483 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB4P17483 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB4P17483 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB4P17483 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB4P17483 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB4P17483 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB4P17483 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB4P17483 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms