Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOT1P17174 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOT1P17174 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOT1P17174 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOT1P17174 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOT1P17174 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOT1P17174 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOT1P17174 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOT1P17174 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOT1P17174 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOT1P17174 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOT1P17174 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOT1P17174 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOT1P17174 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOT1P17174 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOT1P17174 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOT1P17174 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOT1P17174 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOT1P17174 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOT1P17174 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOT1P17174 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOT1P17174 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOT1P17174 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOT1P17174 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GOT1P17174 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOT1P17174 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOT1P17174 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GOT1P17174 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOT1P17174 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOT1P17174 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOT1P17174 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOT1P17174 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOT1P17174 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOT1P17174 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOT1P17174 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOT1P17174 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOT1P17174 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOT1P17174 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOT1P17174 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOT1P17174 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOT1P17174 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOT1P17174 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOT1P17174 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOT1P17174 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOT1P17174 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOT1P17174 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOT1P17174 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOT1P17174 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOT1P17174 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOT1P17174 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOT1P17174 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOT1P17174 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOT1P17174 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOT1P17174 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GOT1P17174 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GOT1P17174 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOT1P17174 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOT1P17174 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOT1P17174 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOT1P17174 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOT1P17174 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOT1P17174 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOT1P17174 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOT1P17174 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOT1P17174 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOT1P17174 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOT1P17174 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOT1P17174 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOT1P17174 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOT1P17174 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOT1P17174 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOT1P17174 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOT1P17174 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOT1P17174 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOT1P17174 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOT1P17174 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOT1P17174 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOT1P17174 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOT1P17174 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOT1P17174 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOT1P17174 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOT1P17174 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOT1P17174 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOT1P17174 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOT1P17174 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOT1P17174 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOT1P17174 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GOT1P17174 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOT1P17174 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOT1P17174 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOT1P17174 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GOT1P17174 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOT1P17174 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOT1P17174 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOT1P17174 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOT1P17174 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOT1P17174 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOT1P17174 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOT1P17174 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOT1P17174 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms