Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IL7RP16871 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IL7RP16871 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL7RP16871 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL7RP16871 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL7RP16871 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL7RP16871 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL7RP16871 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL7RP16871 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL7RP16871 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IL7RP16871 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL7RP16871 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL7RP16871 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL7RP16871 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL7RP16871 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL7RP16871 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
IL7RP16871 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IL7RP16871 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL7RP16871 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL7RP16871 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL7RP16871 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL7RP16871 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL7RP16871 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL7RP16871 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL7RP16871 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
IL7RP16871 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL7RP16871 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL7RP16871 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL7RP16871 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL7RP16871 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL7RP16871 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL7RP16871 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IL7RP16871 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IL7RP16871 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IL7RP16871 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IL7RP16871 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IL7RP16871 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IL7RP16871 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IL7RP16871 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IL7RP16871 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IL7RP16871 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IL7RP16871 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IL7RP16871 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
IL7RP16871 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
IL7RP16871 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IL7RP16871 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IL7RP16871 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IL7RP16871 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IL7RP16871 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IL7RP16871 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IL7RP16871 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IL7RP16871 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IL7RP16871 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
IL7RP16871 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IL7RP16871 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IL7RP16871 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IL7RP16871 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IL7RP16871 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IL7RP16871 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IL7RP16871 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IL7RP16871 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IL7RP16871 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IL7RP16871 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IL7RP16871 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IL7RP16871 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IL7RP16871 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IL7RP16871 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IL7RP16871 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IL7RP16871 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IL7RP16871 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IL7RP16871 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IL7RP16871 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IL7RP16871 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IL7RP16871 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
IL7RP16871 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL7RP16871 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL7RP16871 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL7RP16871 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL7RP16871 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL7RP16871 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL7RP16871 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL7RP16871 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL7RP16871 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL7RP16871 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL7RP16871 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL7RP16871 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL7RP16871 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL7RP16871 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IL7RP16871 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL7RP16871 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL7RP16871 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL7RP16871 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL7RP16871 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL7RP16871 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL7RP16871 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL7RP16871 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL7RP16871 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
IL7RP16871 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IL7RP16871 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IL7RP16871 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms