Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD46P15529 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD46P15529 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD46P15529 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CD46P15529 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD46P15529 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD46P15529 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD46P15529 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD46P15529 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD46P15529 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD46P15529 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD46P15529 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD46P15529 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD46P15529 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD46P15529 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD46P15529 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD46P15529 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD46P15529 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD46P15529 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD46P15529 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD46P15529 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD46P15529 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CD46P15529 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD46P15529 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD46P15529 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD46P15529 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD46P15529 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD46P15529 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD46P15529 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD46P15529 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD46P15529 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD46P15529 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CD46P15529 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CD46P15529 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD46P15529 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CD46P15529 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD46P15529 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD46P15529 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD46P15529 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD46P15529 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD46P15529 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD46P15529 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD46P15529 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD46P15529 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD46P15529 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD46P15529 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD46P15529 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CD46P15529 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD46P15529 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD46P15529 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD46P15529 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD46P15529 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD46P15529 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD46P15529 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD46P15529 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD46P15529 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD46P15529 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD46P15529 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD46P15529 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD46P15529 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD46P15529 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD46P15529 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD46P15529 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD46P15529 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD46P15529 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD46P15529 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD46P15529 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD46P15529 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD46P15529 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD46P15529 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD46P15529 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD46P15529 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD46P15529 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD46P15529 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD46P15529 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD46P15529 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD46P15529 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD46P15529 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD46P15529 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD46P15529 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD46P15529 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD46P15529 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD46P15529 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD46P15529 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD46P15529 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD46P15529 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD46P15529 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD46P15529 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD46P15529 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD46P15529 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD46P15529 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD46P15529 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD46P15529 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CD46P15529 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD46P15529 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD46P15529 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD46P15529 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD46P15529 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD46P15529 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD46P15529 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms