Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CETPP11597 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CETPP11597 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CETPP11597 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CETPP11597 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CETPP11597 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CETPP11597 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CETPP11597 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CETPP11597 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CETPP11597 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CETPP11597 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CETPP11597 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CETPP11597 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CETPP11597 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CETPP11597 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CETPP11597 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CETPP11597 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CETPP11597 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CETPP11597 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CETPP11597 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CETPP11597 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CETPP11597 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CETPP11597 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CETPP11597 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CETPP11597 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CETPP11597 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CETPP11597 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CETPP11597 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CETPP11597 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CETPP11597 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CETPP11597 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CETPP11597 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CETPP11597 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CETPP11597 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CETPP11597 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CETPP11597 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CETPP11597 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CETPP11597 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CETPP11597 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CETPP11597 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CETPP11597 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CETPP11597 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CETPP11597 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CETPP11597 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CETPP11597 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CETPP11597 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CETPP11597 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CETPP11597 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CETPP11597 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CETPP11597 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CETPP11597 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CETPP11597 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CETPP11597 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CETPP11597 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CETPP11597 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CETPP11597 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CETPP11597 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CETPP11597 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CETPP11597 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CETPP11597 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CETPP11597 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CETPP11597 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CETPP11597 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CETPP11597 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CETPP11597 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CETPP11597 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CETPP11597 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CETPP11597 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CETPP11597 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CETPP11597 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CETPP11597 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CETPP11597 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CETPP11597 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CETPP11597 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CETPP11597 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CETPP11597 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CETPP11597 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CETPP11597 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CETPP11597 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CETPP11597 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CETPP11597 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CETPP11597 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CETPP11597 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CETPP11597 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CETPP11597 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CETPP11597 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CETPP11597 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CETPP11597 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CETPP11597 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CETPP11597 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CETPP11597 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CETPP11597 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CETPP11597 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CETPP11597 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CETPP11597 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CETPP11597 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CETPP11597 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CETPP11597 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CETPP11597 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CETPP11597 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.8 ms