Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOP1P11387 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOP1P11387 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOP1P11387 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TOP1P11387 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TOP1P11387 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TOP1P11387 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TOP1P11387 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TOP1P11387 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TOP1P11387 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TOP1P11387 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TOP1P11387 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TOP1P11387 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TOP1P11387 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOP1P11387 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOP1P11387 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOP1P11387 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOP1P11387 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOP1P11387 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOP1P11387 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOP1P11387 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOP1P11387 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOP1P11387 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOP1P11387 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOP1P11387 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TOP1P11387 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1P11387 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1P11387 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1P11387 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1P11387 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1P11387 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1P11387 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1P11387 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1P11387 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1P11387 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1P11387 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1P11387 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1P11387 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TOP1P11387 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOP1P11387 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TOP1P11387 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOP1P11387 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOP1P11387 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TOP1P11387 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TOP1P11387 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOP1P11387 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOP1P11387 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOP1P11387 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOP1P11387 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TOP1P11387 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOP1P11387 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOP1P11387 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOP1P11387 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOP1P11387 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOP1P11387 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TOP1P11387 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOP1P11387 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TOP1P11387 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP1P11387 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP1P11387 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP1P11387 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP1P11387 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP1P11387 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP1P11387 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP1P11387 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP1P11387 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP1P11387 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP1P11387 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP1P11387 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TOP1P11387 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOP1P11387 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOP1P11387 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOP1P11387 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOP1P11387 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOP1P11387 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TOP1P11387 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TOP1P11387 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TOP1P11387 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TOP1P11387 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TOP1P11387 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TOP1P11387 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP1P11387 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP1P11387 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP1P11387 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP1P11387 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP1P11387 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP1P11387 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP1P11387 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP1P11387 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP1P11387 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP1P11387 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP1P11387 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP1P11387 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP1P11387 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP1P11387 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TOP1P11387 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1P11387 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1P11387 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1P11387 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TOP1P11387 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms