Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHRNB1P11230 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRNB1P11230 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms