Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAMP11215 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAMP11215 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAMP11215 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAMP11215 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAMP11215 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGAMP11215 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAMP11215 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGAMP11215 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms