Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GZMBP10144 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GZMBP10144 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GZMBP10144 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GZMBP10144 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GZMBP10144 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GZMBP10144 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GZMBP10144 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GZMBP10144 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GZMBP10144 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GZMBP10144 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GZMBP10144 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GZMBP10144 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GZMBP10144 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GZMBP10144 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GZMBP10144 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GZMBP10144 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GZMBP10144 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GZMBP10144 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GZMBP10144 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GZMBP10144 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GZMBP10144 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GZMBP10144 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GZMBP10144 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GZMBP10144 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GZMBP10144 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GZMBP10144 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GZMBP10144 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GZMBP10144 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GZMBP10144 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GZMBP10144 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GZMBP10144 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GZMBP10144 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GZMBP10144 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GZMBP10144 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GZMBP10144 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GZMBP10144 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GZMBP10144 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GZMBP10144 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GZMBP10144 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GZMBP10144 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GZMBP10144 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GZMBP10144 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GZMBP10144 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GZMBP10144 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GZMBP10144 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GZMBP10144 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GZMBP10144 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GZMBP10144 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GZMBP10144 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GZMBP10144 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GZMBP10144 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GZMBP10144 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GZMBP10144 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GZMBP10144 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GZMBP10144 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GZMBP10144 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GZMBP10144 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GZMBP10144 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GZMBP10144 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GZMBP10144 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GZMBP10144 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GZMBP10144 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GZMBP10144 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GZMBP10144 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GZMBP10144 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GZMBP10144 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GZMBP10144 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GZMBP10144 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GZMBP10144 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GZMBP10144 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GZMBP10144 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GZMBP10144 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GZMBP10144 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GZMBP10144 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GZMBP10144 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GZMBP10144 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GZMBP10144 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GZMBP10144 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GZMBP10144 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms