Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV1-8P0DP01 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGHV1-8P0DP01 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms