Protein–RNA interactions for Protein: P0DMU3

FAM231A/C-like protein LOC102723383, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0DMU3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0DMU3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0DMU3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0DMU3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0DMU3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0DMU3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0DMU3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0DMU3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0DMU3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0DMU3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0DMU3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0DMU3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0DMU3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0DMU3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0DMU3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0DMU3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P0DMU3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P0DMU3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P0DMU3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P0DMU3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P0DMU3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P0DMU3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P0DMU3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P0DMU3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P0DMU3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P0DMU3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P0DMU3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P0DMU3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P0DMU3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P0DMU3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P0DMU3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P0DMU3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P0DMU3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P0DMU3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P0DMU3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P0DMU3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P0DMU3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P0DMU3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P0DMU3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P0DMU3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P0DMU3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P0DMU3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P0DMU3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P0DMU3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P0DMU3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P0DMU3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P0DMU3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P0DMU3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P0DMU3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P0DMU3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P0DMU3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P0DMU3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P0DMU3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P0DMU3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P0DMU3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P0DMU3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P0DMU3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P0DMU3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
P0DMU3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
P0DMU3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P0DMU3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0DMU3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0DMU3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0DMU3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0DMU3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0DMU3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P0DMU3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0DMU3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0DMU3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0DMU3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0DMU3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0DMU3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0DMU3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0DMU3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P0DMU3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P0DMU3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms