Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM17P0DL12 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM17P0DL12 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms