Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SAA1P0DJI8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAA1P0DJI8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms