Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRSS56P0CW18 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms