Protein–RNA interactions for Protein: P0CG36

CFC1B, Cryptic family protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1BP0CG36 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CFC1BP0CG36 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CFC1BP0CG36 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms