Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM200BP0CF97 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms