Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR2MP0CAP2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2MP0CAP2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms