Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00032P0C843 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms