Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN2P0C2S0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN2P0C2S0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN2P0C2S0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN2P0C2S0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN2P0C2S0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN2P0C2S0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN2P0C2S0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN2P0C2S0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN2P0C2S0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN2P0C2S0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN2P0C2S0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN2P0C2S0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN2P0C2S0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN2P0C2S0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN2P0C2S0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTXN2P0C2S0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms