Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MMP10P09238 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MMP10P09238 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MMP10P09238 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MMP10P09238 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MMP10P09238 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MMP10P09238 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MMP10P09238 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MMP10P09238 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MMP10P09238 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MMP10P09238 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MMP10P09238 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MMP10P09238 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MMP10P09238 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MMP10P09238 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MMP10P09238 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MMP10P09238 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MMP10P09238 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MMP10P09238 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MMP10P09238 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MMP10P09238 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MMP10P09238 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MMP10P09238 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MMP10P09238 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP10P09238 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP10P09238 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP10P09238 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP10P09238 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP10P09238 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP10P09238 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP10P09238 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP10P09238 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP10P09238 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP10P09238 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP10P09238 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MMP10P09238 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MMP10P09238 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MMP10P09238 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MMP10P09238 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MMP10P09238 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MMP10P09238 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MMP10P09238 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MMP10P09238 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MMP10P09238 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MMP10P09238 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MMP10P09238 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MMP10P09238 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MMP10P09238 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MMP10P09238 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MMP10P09238 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MMP10P09238 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MMP10P09238 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MMP10P09238 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MMP10P09238 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMP10P09238 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMP10P09238 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMP10P09238 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMP10P09238 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMP10P09238 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMP10P09238 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMP10P09238 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMP10P09238 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MMP10P09238 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MMP10P09238 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MMP10P09238 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MMP10P09238 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MMP10P09238 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MMP10P09238 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MMP10P09238 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MMP10P09238 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MMP10P09238 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MMP10P09238 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MMP10P09238 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MMP10P09238 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MMP10P09238 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MMP10P09238 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MMP10P09238 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP10P09238 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP10P09238 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP10P09238 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP10P09238 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP10P09238 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP10P09238 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP10P09238 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP10P09238 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP10P09238 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP10P09238 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP10P09238 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP10P09238 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP10P09238 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP10P09238 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP10P09238 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP10P09238 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP10P09238 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP10P09238 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP10P09238 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP10P09238 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP10P09238 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP10P09238 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP10P09238 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms