Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT19P08727 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT19P08727 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT19P08727 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT19P08727 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT19P08727 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT19P08727 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT19P08727 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT19P08727 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT19P08727 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT19P08727 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT19P08727 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT19P08727 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT19P08727 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT19P08727 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT19P08727 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT19P08727 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT19P08727 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT19P08727 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT19P08727 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT19P08727 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT19P08727 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT19P08727 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT19P08727 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT19P08727 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT19P08727 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT19P08727 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT19P08727 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT19P08727 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT19P08727 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT19P08727 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT19P08727 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT19P08727 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT19P08727 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT19P08727 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT19P08727 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT19P08727 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT19P08727 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT19P08727 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT19P08727 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT19P08727 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT19P08727 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT19P08727 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT19P08727 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT19P08727 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT19P08727 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT19P08727 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT19P08727 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT19P08727 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT19P08727 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT19P08727 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT19P08727 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT19P08727 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT19P08727 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT19P08727 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT19P08727 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT19P08727 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT19P08727 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT19P08727 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT19P08727 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT19P08727 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT19P08727 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT19P08727 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT19P08727 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT19P08727 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT19P08727 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT19P08727 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT19P08727 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT19P08727 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT19P08727 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT19P08727 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT19P08727 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT19P08727 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT19P08727 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
KRT19P08727 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT19P08727 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT19P08727 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT19P08727 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT19P08727 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT19P08727 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms