Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRPRAP08240 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRPRAP08240 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRPRAP08240 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms