Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM2P07951 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM2P07951 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM2P07951 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM2P07951 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM2P07951 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM2P07951 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM2P07951 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM2P07951 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM2P07951 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM2P07951 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM2P07951 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM2P07951 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TPM2P07951 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TPM2P07951 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TPM2P07951 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TPM2P07951 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TPM2P07951 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM2P07951 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM2P07951 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM2P07951 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM2P07951 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM2P07951 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM2P07951 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM2P07951 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM2P07951 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM2P07951 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM2P07951 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM2P07951 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM2P07951 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM2P07951 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM2P07951 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM2P07951 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM2P07951 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM2P07951 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM2P07951 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM2P07951 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM2P07951 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM2P07951 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM2P07951 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM2P07951 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM2P07951 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM2P07951 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM2P07951 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM2P07951 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM2P07951 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM2P07951 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM2P07951 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM2P07951 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM2P07951 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM2P07951 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM2P07951 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM2P07951 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPM2P07951 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPM2P07951 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPM2P07951 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPM2P07951 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPM2P07951 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPM2P07951 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPM2P07951 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPM2P07951 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPM2P07951 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPM2P07951 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM2P07951 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM2P07951 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM2P07951 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM2P07951 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM2P07951 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM2P07951 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM2P07951 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM2P07951 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM2P07951 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM2P07951 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM2P07951 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM2P07951 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM2P07951 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM2P07951 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM2P07951 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPM2P07951 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPM2P07951 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPM2P07951 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TPM2P07951 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPM2P07951 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPM2P07951 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPM2P07951 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPM2P07951 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM2P07951 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM2P07951 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM2P07951 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM2P07951 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM2P07951 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM2P07951 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM2P07951 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM2P07951 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM2P07951 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM2P07951 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM2P07951 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM2P07951 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM2P07951 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPM2P07951 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms