Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLK3P07288 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLK3P07288 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLK3P07288 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KLK3P07288 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLK3P07288 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLK3P07288 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLK3P07288 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLK3P07288 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KLK3P07288 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLK3P07288 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLK3P07288 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLK3P07288 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLK3P07288 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLK3P07288 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLK3P07288 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLK3P07288 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLK3P07288 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLK3P07288 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLK3P07288 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLK3P07288 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLK3P07288 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLK3P07288 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLK3P07288 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLK3P07288 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLK3P07288 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLK3P07288 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLK3P07288 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLK3P07288 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLK3P07288 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLK3P07288 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLK3P07288 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLK3P07288 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLK3P07288 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLK3P07288 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLK3P07288 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLK3P07288 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLK3P07288 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLK3P07288 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLK3P07288 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLK3P07288 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLK3P07288 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLK3P07288 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLK3P07288 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLK3P07288 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLK3P07288 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLK3P07288 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLK3P07288 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLK3P07288 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLK3P07288 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLK3P07288 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLK3P07288 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLK3P07288 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLK3P07288 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLK3P07288 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLK3P07288 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLK3P07288 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLK3P07288 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KLK3P07288 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLK3P07288 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLK3P07288 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLK3P07288 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLK3P07288 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLK3P07288 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLK3P07288 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLK3P07288 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLK3P07288 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLK3P07288 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLK3P07288 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLK3P07288 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLK3P07288 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLK3P07288 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLK3P07288 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLK3P07288 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLK3P07288 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLK3P07288 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLK3P07288 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLK3P07288 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLK3P07288 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLK3P07288 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms