Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CENPBP07199 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CENPBP07199 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CENPBP07199 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CENPBP07199 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CENPBP07199 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CENPBP07199 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CENPBP07199 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CENPBP07199 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CENPBP07199 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CENPBP07199 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CENPBP07199 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CENPBP07199 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CENPBP07199 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CENPBP07199 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CENPBP07199 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CENPBP07199 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CENPBP07199 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CENPBP07199 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CENPBP07199 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CENPBP07199 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CENPBP07199 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CENPBP07199 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CENPBP07199 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CENPBP07199 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CENPBP07199 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CENPBP07199 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CENPBP07199 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CENPBP07199 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CENPBP07199 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CENPBP07199 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CENPBP07199 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CENPBP07199 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CENPBP07199 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CENPBP07199 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CENPBP07199 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CENPBP07199 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CENPBP07199 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CENPBP07199 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CENPBP07199 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CENPBP07199 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CENPBP07199 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
CENPBP07199 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CENPBP07199 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CENPBP07199 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CENPBP07199 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CENPBP07199 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CENPBP07199 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CENPBP07199 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CENPBP07199 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CENPBP07199 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CENPBP07199 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CENPBP07199 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CENPBP07199 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CENPBP07199 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CENPBP07199 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CENPBP07199 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CENPBP07199 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CENPBP07199 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CENPBP07199 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPBP07199 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPBP07199 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPBP07199 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPBP07199 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPBP07199 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPBP07199 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPBP07199 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPBP07199 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPBP07199 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPBP07199 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPBP07199 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPBP07199 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPBP07199 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPBP07199 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPBP07199 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPBP07199 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPBP07199 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPBP07199 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPBP07199 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPBP07199 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPBP07199 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPBP07199 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPBP07199 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPBP07199 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPBP07199 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CENPBP07199 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CENPBP07199 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CENPBP07199 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CENPBP07199 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CENPBP07199 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CENPBP07199 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CENPBP07199 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CENPBP07199 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CENPBP07199 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CENPBP07199 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CENPBP07199 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CENPBP07199 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CENPBP07199 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CENPBP07199 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CENPBP07199 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms