Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24AO95486 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24AO95486 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms