Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TNFRSF6BO95407 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF6BO95407 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms