Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RAPGEF3O95398 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RAPGEF3O95398 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC34■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms