Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPF6O94906 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF6O94906 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms