Protein–RNA interactions for Protein: O94844

RHOBTB1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB1O94844 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOBTB1O94844 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOBTB1O94844 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms