Protein–RNA interactions for Protein: O75764

TCEA3, Transcription elongation factor A protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA3O75764 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEA3O75764 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEA3O75764 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEA3O75764 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEA3O75764 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCEA3O75764 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TCEA3O75764 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCEA3O75764 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms