Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM3O75607 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM3O75607 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM3O75607 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM3O75607 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM3O75607 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM3O75607 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM3O75607 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM3O75607 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM3O75607 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM3O75607 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM3O75607 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM3O75607 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM3O75607 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM3O75607 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM3O75607 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM3O75607 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM3O75607 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM3O75607 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM3O75607 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM3O75607 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM3O75607 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM3O75607 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM3O75607 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM3O75607 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM3O75607 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM3O75607 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM3O75607 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM3O75607 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM3O75607 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM3O75607 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM3O75607 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM3O75607 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM3O75607 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM3O75607 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM3O75607 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM3O75607 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM3O75607 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM3O75607 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM3O75607 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM3O75607 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM3O75607 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM3O75607 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM3O75607 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM3O75607 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM3O75607 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM3O75607 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM3O75607 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM3O75607 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM3O75607 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM3O75607 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM3O75607 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM3O75607 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM3O75607 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM3O75607 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM3O75607 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM3O75607 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM3O75607 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPM3O75607 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPM3O75607 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPM3O75607 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPM3O75607 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPM3O75607 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPM3O75607 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NPM3O75607 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPM3O75607 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPM3O75607 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPM3O75607 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM3O75607 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM3O75607 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM3O75607 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM3O75607 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM3O75607 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM3O75607 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM3O75607 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM3O75607 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM3O75607 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM3O75607 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM3O75607 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM3O75607 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM3O75607 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM3O75607 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM3O75607 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM3O75607 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM3O75607 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM3O75607 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM3O75607 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM3O75607 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM3O75607 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM3O75607 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM3O75607 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM3O75607 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM3O75607 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM3O75607 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM3O75607 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM3O75607 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM3O75607 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM3O75607 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM3O75607 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM3O75607 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms