Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCA5O60264 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA5O60264 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA5O60264 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA5O60264 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA5O60264 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA5O60264 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA5O60264 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA5O60264 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCA5O60264 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA5O60264 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA5O60264 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA5O60264 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA5O60264 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA5O60264 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA5O60264 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA5O60264 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA5O60264 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA5O60264 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA5O60264 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA5O60264 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA5O60264 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCA5O60264 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA5O60264 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA5O60264 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA5O60264 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA5O60264 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA5O60264 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA5O60264 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA5O60264 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA5O60264 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCA5O60264 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA5O60264 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA5O60264 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA5O60264 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA5O60264 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA5O60264 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA5O60264 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCA5O60264 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA5O60264 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA5O60264 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA5O60264 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA5O60264 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA5O60264 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA5O60264 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA5O60264 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCA5O60264 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA5O60264 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA5O60264 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA5O60264 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA5O60264 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA5O60264 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA5O60264 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA5O60264 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA5O60264 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCA5O60264 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SMARCA5O60264 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SMARCA5O60264 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms