Protein–RNA interactions for Protein: O43513

MED7, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED7O43513 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED7O43513 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MED7O43513 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MED7O43513 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MED7O43513 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED7O43513 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED7O43513 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED7O43513 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED7O43513 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED7O43513 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED7O43513 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED7O43513 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED7O43513 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED7O43513 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED7O43513 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED7O43513 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED7O43513 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED7O43513 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED7O43513 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED7O43513 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MED7O43513 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED7O43513 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MED7O43513 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED7O43513 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED7O43513 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED7O43513 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED7O43513 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED7O43513 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED7O43513 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED7O43513 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MED7O43513 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED7O43513 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED7O43513 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED7O43513 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED7O43513 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED7O43513 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED7O43513 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED7O43513 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED7O43513 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED7O43513 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED7O43513 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED7O43513 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED7O43513 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED7O43513 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MED7O43513 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED7O43513 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED7O43513 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED7O43513 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED7O43513 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED7O43513 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED7O43513 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED7O43513 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED7O43513 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED7O43513 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED7O43513 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED7O43513 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED7O43513 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED7O43513 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED7O43513 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MED7O43513 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED7O43513 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED7O43513 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED7O43513 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED7O43513 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED7O43513 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED7O43513 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED7O43513 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED7O43513 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED7O43513 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED7O43513 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED7O43513 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED7O43513 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED7O43513 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED7O43513 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED7O43513 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED7O43513 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED7O43513 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED7O43513 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MED7O43513 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED7O43513 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED7O43513 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED7O43513 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED7O43513 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED7O43513 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MED7O43513 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED7O43513 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED7O43513 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED7O43513 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED7O43513 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED7O43513 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED7O43513 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED7O43513 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED7O43513 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED7O43513 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED7O43513 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED7O43513 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED7O43513 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MED7O43513 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED7O43513 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED7O43513 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms