Protein–RNA interactions for Protein: O43280

TREH, Trehalase, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREHO43280 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TREHO43280 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TREHO43280 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TREHO43280 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TREHO43280 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TREHO43280 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TREHO43280 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TREHO43280 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TREHO43280 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TREHO43280 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TREHO43280 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TREHO43280 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TREHO43280 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TREHO43280 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TREHO43280 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TREHO43280 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREHO43280 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREHO43280 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREHO43280 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREHO43280 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREHO43280 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TREHO43280 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREHO43280 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TREHO43280 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREHO43280 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREHO43280 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREHO43280 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREHO43280 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TREHO43280 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREHO43280 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREHO43280 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREHO43280 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREHO43280 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREHO43280 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREHO43280 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREHO43280 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREHO43280 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREHO43280 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREHO43280 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREHO43280 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREHO43280 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREHO43280 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREHO43280 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREHO43280 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREHO43280 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREHO43280 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREHO43280 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREHO43280 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREHO43280 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREHO43280 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREHO43280 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREHO43280 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREHO43280 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREHO43280 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TREHO43280 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREHO43280 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREHO43280 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREHO43280 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREHO43280 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREHO43280 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREHO43280 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREHO43280 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREHO43280 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREHO43280 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREHO43280 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREHO43280 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREHO43280 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREHO43280 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TREHO43280 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREHO43280 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREHO43280 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREHO43280 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TREHO43280 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TREHO43280 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TREHO43280 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TREHO43280 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TREHO43280 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TREHO43280 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TREHO43280 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TREHO43280 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TREHO43280 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TREHO43280 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TREHO43280 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TREHO43280 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TREHO43280 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TREHO43280 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TREHO43280 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TREHO43280 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TREHO43280 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TREHO43280 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TREHO43280 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TREHO43280 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TREHO43280 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TREHO43280 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TREHO43280 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TREHO43280 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TREHO43280 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TREHO43280 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TREHO43280 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TREHO43280 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms