Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHGDHO43175 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms